Comme prévu j'ai passé ma première journée au labo aujourd'hui. Enfin, bien grand mot... Premier jour comme d'hab c'est faire le tour des installations, prendre connaissance du job à faire et rencontrer les collègues. Donc me voilà sans trop de problème, je trouve le bureau du chef, Matteus Da Silva. 44 ans, forcément d'origine portugaise, marié à une Chinoise 2 enfants... Il m'accueille super bien, vraiment amical, grand sourire, il m'explique un peu tout sur le labo, et comme quoi comme je viens 2 mois faudrait que je puisse checker un peu ce que fait chaque personne en particulier, et surtout que je puisse visiter le pays, m'amuser, sortir... Genre tant que je le préviens si je viens pas, parce que je suis malade, que j'ai trop fait la noce ou que je suis partie avec un acteur faire le tour du pays (ce qui est arrivé avec son ancien stagiaire d'ailleurs), tout va bien. On verra si en pratique il garde quand même toujours cette approche. En plus il me dit aussi que si j'ai un projet ou que j'ai envie de tester des trucs en plus y a pas de souci, je peux y aller et tout... Vraiment trop trop trop trop cool, mais bon en 2 mois, c'est juste pas trop faisable mais au moins je sais que je peux donner un peu de mes idées et tout et que je suis pas juste là pour faire la déco. En plus le gars a bien insisté pour dire qu'ils allaient publier dans pas long leurs recherches et qu'ils allaient pas m'oublier, et que si j'avais besoin d'une référence pour un job y a pas de souci.
Donc ensuite j'ai rencontré la team, forcément 3 jaunes et un irlandais... Il y a donc Gigi, chinoise un peu réservée mais fan de basket et badminton, qui a l'air fort sympathique, Chantal (pas sure du nom :s) l'exubérante taiwanaise dont le rêve est de retourner à Taiwan ouvrir un magasin d'animaux, mais seulement pour les chiens, Nason (ça se dit Néyssonne en vrai au cas où) l'Irlandais qui a une tête de papy (sisi je t'assure) très accueillant et tout, c'est un peu la référence du groupe comme c'est le seul a vraiment parler anglais comme il faut. J'ai été manger avec eux à la cafet que j'ai longtemps cherché hier sans succès, mais bon faut vraiment avoir envie de se paumer pour mettre la cafet la ou elle est. Bonne bouffe d'ailleurs pas trop cher a part que les spaghettis bolognaise pré-coupés, avec des champignons c'est quand même du jamais vu. On fait un peu connaissance, vraiment sympa, bonne ambiance d'équipe.
Et finalement je retrouve Dennis le copaing que j'ai rencontré dans le train hier soir. Tout beau stressé parce qu'il rentre d'Edimburgh et qu'il a mille rapports à finir. Ca sera bien lui qui sera responsable de moi, donc il m'explique un peu son projet perso et me fait faire le tour du labo, c'est vraiment récent donc assez la classe et bien équipé. Voilà après Dennis devait se remettre à ses rapports donc j'ai fait un peu des recherches internet pour lire 2-3 publications sur le sujet et voila rentrée, sur-boostée, rien à redire. Les gens sont super cool, jeunes, motivés, marrants, le labo est top niveau, le chef est génial et le sujet passionnant. Rien à dire quoi. Demain matin j'aurai un cours de sécurité au labo pour bosser avec la radioactivité, genre on s'en fout mais ils me donneront un certificat de "je sais bosser avec des radioactivités" donc c'est cool quand même.
Bon je vais quand même essayer de vous expliquer ce que je vais faire comme projet dans ce labo. Vous pouvez aussi aller voir sur le site internet du lab en question. Donc comme vous le savez peut-être (ça date de 1953 alors un petit effort) l'ADN est sous forme de double hélice. Les bases s'apparient par paire au milieu. A avec T, G avec C. Les gènes sont donc fait d'une suite de ces ATGC. OK? Sauf que dans certaines régions, notemment dans des gènes pouvant provoquer le cancer (oncogènes), on retrouve parfois des suites spécifiques de G. Et ces GGGGGGGGGG forme des structures spécifiques: des quadruplexes. Genre ils préfèrent se coller entre eux que de former la double hélice. Ces quadruplexes empèchent alors l'expression du gène. Et c'est ça qu'on cherche à faire: trouver un moyen de stabiliser ces structures quadruplexes dans les oncogènes pour stopper l'expression des gènes du cancer. Le but est de trouver une molécule spécifique (un ligand) qui ne se lie que dans une sorte de ces structures pour spéficiquement toucher que le gène voulu. L'avantage de cette technique par rapport à d'autres (comme le RNA interférence) c'est qu'on agit directement sur le gène, et que la molécule qui doit agir n'est pas dégradée par les RNAses et autres.
Les techniques que je vais utiliser (oubliez les non-initiés, ca va être compliqué...) pour ce projet sont la Polmerase Stop Assay pour vérifier la formation de quadruplexes qui bloquent la PCR et donc on aura divers petits bouts sur le gel au lieu d'un long. La S1 Nuclease, ça aussi ça permet de checker la présence des quadruplexes, parce que la nucléase clive quan
d l'ADN n'est pas double-brin donc autour des quadriplexes. Ensuite je vais aussi utiliser une méthode de dialyse pour voir les ligands qui se lient spécifiquement ou non à différentes séquences, puis vérifier par spectrométrie de masse ce qui reste vraiment lié. On va faire un plasmide avec la séquence des quadruplexes lié à la GFP et le transfecter dans des cellules cancéreuse, puis voir si la GFP est exprimée ou non, si elle est pas exprimée c'est que le quadruplexe est bel et bien formé et empèche l'expression de la GFP.Bref j'ai du pain sur la planche, vivement demain!
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